Abyste se vyhnuli davům turistů, kteří se každý den sjíždějí do Vatikánských muzeí, doporučujeme navštívit je po 14. hodině. Ráno je obvykle rušněji, protože mnoho turistů se snaží být první ve frontě. Kromě toho je dobré zkontrolovat kalendář papežských audiencí, protože odvádí davy lidí od muzeí.
Mimo sezónu, která trvá od listopadu do února, navštěvuje muzea méně lidí. V těchto měsících je zde méně lidí. Naopak hlavní měsíce, jako je duben až říjen, často znamenají větší počet návštěvníků a delší fronty.
Ve Vatikánských muzeích a souvisejících objektech se během roku konají různé akce, které mohou ovlivnit počet lidí a jejich dostupnost. Před plánováním návštěvy je vhodné zkontrolovat oficiální kalendář Vatikánských muzeí, zda se v něm nenachází nějaké speciální akce nebo uzavírky. Speciální výstavy nebo svátky mohou výrazně změnit typický návštěvnický provoz.
Nejlepší měsíce pro návštěvu Vatikánských muzeí jsou mimo turistickou sezónu, tedy od listopadu do února. V těchto měsících jsou davy lidí obecně menší a nabízejí intimnější zážitek.
Všední dny jsou obvykle méně přeplněné než víkendy a dny papežských audiencí jsou ideálním dnem pro návštěvu - většinou se konají ve středu -, protože davy lidí jsou odkloněny od muzeí.
Pro ty, kteří raději začínají svůj den brzy, může být výhodou, když se do fronty postaví v 7:30, protože je to před příchodem většiny turistů. V odpoledních hodinách, zejména po 14. hodině, bývá ve Vatikánských muzeích klidněji, protože mnoho návštěvníků se snaží dorazit dříve.
Sixtinská kaple je nejrušnější v poledne. Chcete-li se vyhnout špičce a užít si klidnější návštěvu, měli byste se zaměřit na návštěvu buď brzy ráno, nebo později odpoledne po 16. hodině.
Abyste si zajistili vstup do Vatikánských muzeí, zejména v hlavní turistické sezóně, doporučujeme zakoupit vstupenky alespoň dva týdny předem.